A pesca profissional ou desportiva é uma atividade comum nas albufeiras de Alqueva e Pedrógão. Os concursos de pesca onde participam embarcações com experiência internacional, podem ser uma fonte de novas espécies invasoras imperceptíveis, como o mexilhão-zebra, sendo necessário lavar, desinfetar e secar os barcos antes de os colocar na água. Os efeitos desta espécie são devastadores para o ecossistema.